A história do jogo conta sobre FEAR (First Encounter Assault Recon), um grupo de elite do Exército dos Estados Unidos encarregado de investigar fenômenos sobrenaturais . Quando o programa secreto de pesquisa de uma empresa militar privada dá errado e um perigoso e poderoso médium é libertado, FEAR é chamado, com o jogador assumindo o papel do mais novo recruta da unidade, Point Man. No entanto, logo se torna aparente que há muito mais acontecendo do que um médium desonesto, quando Point Man se vê diante de uma ameaça paranormal letal e imprevisível na forma de uma jovem com extraordinário poder destrutivo.